Primul muzeu din Moldova a fost fondat de baronul Stiuardom încă în anul 1889, şi în decursul secolului XX a fost un laborator de creatie pentru multe persoane, larg cunoscut în lumea științei: S. Miller, F. Osterman, F. Porucica, B. Tarabuhin, I. Suhov, M. Pocoară si m. a.

Clădirea muzeului, construită în stil oriental în anul1905, este o clădire unică în Republica Moldova. De-a lungul istoriei sale, muzeul a fost dedicat la două domenii specifice - studierea naturii si culturii Moldovei. Instituţia în sine a avut mai multe denumiri: Muzeul Naţional Adevărul Istoriei, Muzeul Regional al Basarabiei, Muzeul Republican de Studii ale Ţinutului Natal. Muzeul este popular între vizitatori, datorită colecţiei sale bogate-paleontologice, geologice, zoologice, colecţii arheologice, entomologice, etnografice si numismatice. Printre multele mii de exponate, vizitatorii pot vedea scheletul complet Dinoterium Gigantisimus, şi covoare basarabene din secolul al XIX-lea, comori arheologice celebre si multe altele.

Colecţiile muzeului de multe ori au fost expuse în Europa, Asia, America şi Africa ca o moştenire cultural-naţională din Republica Moldova.

Muzeul este situat în proprietatea arhitecturală şi istorică din Chişinău, construită în anul1889 şi executat în stil pseudo-mavrin. În acest vechi muzeu al Republicii Moldova sunt cele mai bogate şi nepreţuite colecţii. Fondul are mai mult de 135 mii de exponate de importanţă naţională, europeană şi globală, multe exponate au fost expuse în diferite ţări din Europa, Asia, America şi Africa.

Domeniu muzeu, defineşte o colecţie de istorie naturală, etnografie, ştiinţele naturii, istorie, arheologie, cărţi vechi, etc... Colecţiile paleontologice şi geologice reflectă evoluţia lumii organice şi istoria geologică a pămîntului. Acestea includ relicve de floră şi faună, shimbînduse una pe alta în diferite perioade geologice.

Relicva muzeului - schiletul complet supergigant dinateria (Deinoterium gigantissimus), a trăit cîndva pe planeta noastră 7,000,000 ani.

Natura modernă este reprezentată în colecţii zoologice şi botanice.Un loc special îl ocupă ierbarele şi animale împăiate de la sfîrşitul sec. 19-lea - inceputul secolului 20, care au dispărut pentru totdeauna din mediul natural al Republicii Moldova. Colecţiile botanice o completează Grădina Botanică, organizate la muzeu în anul 1906.

Dezvoltarea cultural - istorică a civilizaţiei, reflecta colecţii asupra istoriei, numismatică, arheologie, etnografie si arta. În fondul muzeului există tezaure celebre din satele Lărguţa,Chetroşica, Cărbuna, colecţii nepreţuite de lucruri ţesute, haine naţionale, ceramica, mobilier, arhitectura populară, instrumente muzicale, etc. Aici, este expusă o colecţie  valoroasă de covoare moldoveneşti sfîrşitul sec. 18 începutul sec. 20.

Expoziţii

Expoziţia permanentă a Muzeului de Etnografie şi Istorie Naturală este numită "Natura. Omul. Cultura" face cunoştinţă vizitatorilor cu dezvoltarea relaţiilor omului cu natura mama, reflectînd rolul său important în Univers.
În plus, muzeul oferă vizitatorilor posibilitatea de a face cunoştinţă cu expoziţii mobile, ca exponate proprii şi exponate împrumutate de la alte muzee.