Комната краеведения была открыта в доме пионеров 14 февраля 1964 года, задолго до официального открытия Комратского музея в Гагаузии. Руководителем данной комнаты являлся Анатолий Алексеевич Маринов. Не однократно поднимался вопрос об открытии музея. Для его создания были приложены не малые усилия. Собранные Мариновым материалы, выставленные на экспозиции в доме пионеров, а также его личный архив истории края, стали основой музея, директором которого собственно стал сам Маринов. Все жители Гагаузии считают его основателем музея.

Сегодня в комратском музее хранится более 64 тысяч экспонатов вспомогательного и основного фондов. В его коллекции находятся: нумизматика, филателия, документы 19-20 веков, старинные предметы декоративно-прикладного искусства и быта, местные археологические находки. Также там имеются богатейшие коллекции ручной вышивки, древних минералов, останков древних животных. А в отдельном зале выставлены экспонаты, отражающие культуру и историю гагаузов – тюркского народа, который исповедует христианство, и проживает на юге Республики Молдова.

В 2008 году была проведена конференция тема, которой звучала так: «Репрессии и голод 40-х годов». Мероприятие прошло на высшем уровне. Приглашенными были гости, репрессированные жители края и те, кто желал отдать дань памяти пострадавшим от этой карательной меры. Материалы, освещающие данную тему, были собраны, но соответствующего раздела пока в музее нет.

В музее затронута этнография многих народов. Сегодня рассматривают вопрос о реорганизации музея в дом культуры и этноса гагаузов. Он будет более узко направлен на историю именно народа Гагаузии.  Данный вопрос окружен разногласиями, так как эту позицию поддерживают не все.